Budowę przydomowej instalacji oczyszczającej warto rozpocząć od przygotowania szczegółowego planu. Należy na nim zaznaczyć odległość oczyszczalni od studni, od zabudowań mieszkalnych, a także od granicy działki i innych instalacji. Lokalizacja przydomowej oczyszczalni ścieków nie może być przypadkowa, lecz zgodna z regulacjami ustawowymi.
Kiedy mówimy o lokalizacji przydomowej oczyszczalni ścieków, to mamy na myśli zbiornik oczyszczalni biologicznej, osadnik gnilny i poletko rozsączające oczyszczalni drenażowej.
Najważniejszym aktem, który określa lokalizację przydomowych systemów oczyszczających, jest Rozporządzenie Ministra Infrastruktury z dnia 12 kwietnia 2002 r. w sprawie warunków technicznych, jakim powinny odpowiadać budynki i ich usytuowanie. Zgodnie z nim przydomowa oczyszczalnia ścieków powinna zachować minimalne odległości od następujących obiektów:
Dość nietypową sytuacją jest posadowienie oczyszczalni drenażowej w sąsiedztwie zbiorników wodnych, na których działają kąpieliska. Odprowadzenie ścieku do ziemi nie może znajdować się bliżej niż 1000 m od kąpieliska. Oczywiście zakazane jest kierowanie odpływów z przydomowych oczyszczalni ścieków bezpośrednio do wód stojących lub podziemnych.
Ważną kwestią jest lokalizacja przydomowych oczyszczalni ścieków na działkach o dużym spadku oraz usytuowanych na wzniesieniach lub w zagłębieniach terenu. W przypadku wzniesień problemem jest tłoczenie ścieków od wyprowadzenia z budynku do oczyszczalni lub zbiornika bezodpływowego (szamba). W takiej sytuacji konieczna jest budowa niewielkich przepompowni. Z kolei lokalizacja zbiorników na nieczystości w zagłębieniach terenu stwarza ryzyko zalewania wodami opadowymi. Efektem może być zablokowanie drenażu rozsączającego i ustanie procesów oczyszczania, przepełnienie i wybicie szamba, a nawet cofanie się ścieków w instalacji oczyszczającej.
Kwestią, na którą trzeba zwrócić uwagę przy lokalizacji zbiornika oczyszczalni lub szamba, jest obecność roślin. Jeżeli w sąsiedztwie rosną duże drzewa, to ich rozgałęzione korzenie sprawią spore problemy w trakcie prac ziemnych. Może okazać się, że konieczne będzie usunięcie całego drzewa. Należy też zachować odpowiednią odległość przy nasadzeniach drzew i krzewów w sąsiedztwie oczyszczalni, w tym szczególnie w pobliżu i na samych poletkach rozsączających. Oczyszczony lub podczyszczony ściek jest dobrym nawozem, który będzie sprzyjał szybkiemu rozrostowi roślin. Korzenie mogą w ciągu kilku lat doprowadzić do zniszczenia drenażu, a nawet do uszkodzeń betonowych elementów systemów odprowadzania ścieków.
Na zakończenia warto wspomnieć o rzeczy oczywistej, czyli o zapewnieniu łatwego dojazdu do szamba lub przydomowej oczyszczalni ścieków. Jest to szczególnie ważne w przypadku zbiorników bezodpływowych, które opróżniane są regularnie co 2-3 tygodnie.